On peut y voir la porte originelle de l’église abbatiale : son archivolte moulurée en plein cintre repose sur une console jouxtant une niche qui abrita jadis un bénitier. Le tympan semi-circulaire est orné d’une fresque représentant deux anges agenouillés portant calice et datée du 15e siècle.

En se dirigeant vers la galerie Ouest, on pourra également observer une pierre ornée d’entrelacs, de type carolingien (8e siècle) et utilisée en réemploi.

Elle s’ouvrait sur la salle capitulaire, le logis abbatial, la bibliothèque, le scriptorium et le dortoir à l’étage.

Actuellement, on ne visite qu’une salle : le logis abbatial.
Cette pièce est dotée d’un remarquable plafond peint à la française du tout début du 16e siècle qui offre un répertoire floral et animal, ainsi que différentes scènes (artisans au travail, chasse, fauconnerie, scène galante ou humoristique…). Ses murs sont ornés de peintures du 19e siècle représentant les armoiries des 55 abbés de Saint Hilaire.

De nos jours, on ne visite qu’une petite partie de cette aile qui abritait les caves, greniers et celliers de l’abbaye.

En empruntant un escalier, on accède à une de ces caves taillée à même la roche (grès et poudingue**).

A l’intérieur, on observe quatre ouvertures ou silos aménagés dans la voûte, qui permettaient aux paysans de déverser les cultures, sans avoir de contact avec les moines.

Enfin, c’est dans cette même cave que les moines découvrirent en 1531, la Blanquette de Limoux.

L’église abbatiale, construite à la fin du 12e siècle, possède un plan simple : une nef unique terminée par une abside en cul de four et deux chapelles latérales formant un faux transept.
Chacune d'elle disposait d’une absidiole; celle située au Nord a été supprimée lors de la construction de la sacristie.

La nef est constituée de trois travées voûtées d’ogives. Ses arcs doubleaux reposent sur des colonnes engagées terminées par des figures anthropomorphes, des personnages à type d’Atlante, des motifs végétaux et des animaux fabuleux.
Les chapiteaux de ces mêmes colonnes représentent des animaux, des végétaux ; un seul est historié et présente sans doute une procession de moines.

Les clés de voûte de la nef représentent la Sainte Trinité : l’agneau de Jésus, la main bénissante de Dieu et la colombe du Saint Esprit (aujourd’hui disparue).